ted怎么看植物真菌的简单介绍

ted演讲在哪看?

ted演讲可以在网易公开课上看。里面有双语版的TED，中文版一般都是翻译过的，ted原版视频一般都没中文，在喜马拉雅App搜索TED中文演讲即可免费收听，Tedtalk就是TED演讲，TED指technology， entertainment， design在英语中的缩写。

ted演讲的由来

即技术娱乐设计是美国的一家私有非营利机构，该机构以它组织的TED大会著称，这个会议的宗旨是值得传播的创意，TED国际会议于1984年*一次召开，由里查德沃曼和哈里马克思共同创办，从1990年开始每年在美国加州的蒙特利举办一次。

而如今也会选择其他城市每年举办一次，它邀请世界上的思想*与实干家来分享他们很热衷从事的事业，TED它是美国的一家私有非盈利机构该机构以它组织的TED大会著称TED，TED演讲是由TED从每年1000人的俱乐部变成了一个每天10万人流量的社区。

怎么在电脑上看TED视频？

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2】Mycorrhizal networks

一、菌丝和植物的亲和性强弱决定了网络的结构，决定有哪些植物/真菌可以参与到这个网络中。因此了解亲和性、专一性这些问题对于解构和预测菌丝网络至关重要

一、两方面：真菌的寄主范围，和植物的菌根范围

二、亲和性的连续谱

1. 从低亲和到高亲和，真菌所能形成关系的植物种类越来越少——很特异的菌根共生只和少数植物形成

2. 术语

① Host specialist寄主专性菌: 只和少数植物（一般是同属）能有效共生的菌

② Generalist 寄主广性菌：几乎没有限制，或者能和很多不同分类单元植物共生

③ Ecological specificity：生态特异性。类比生态位中的基础生态位和实际生态位那样，实验室条件下测量的特异性和实际生态环境中表现出的特异性不一定一样。一般的，由于环境因素和寄主选择偏好等因素，生态特异性要低于实验室结果

④ Host preference：寄主偏好。一些菌根受到环境的影响相对较小，总是只和少数植物建立共生关系。在外生和丛枝菌根中均存在这样的情况

⑤ Functional specificity功能特异性：真菌对于不同的植物呈现不同程度的帮助。指真菌响应不同的植物的动态变化的偏好性

3. 动态变化的真菌-植物-环境三角

① 实验的证据

A. 具有明显孢子果的外生菌根，和容易取得纯孢子内生菌根，这些素材的孢子实验对于共生性问题提供了好的依据

B. 然而难点在于，很多菌根不产生明显的孢子体或容易分离辨别的繁殖结构，因此数据只能来自野外采集的植物材料鉴定，这样得出的菌根关系只是“生态特异性”的结果，不够有代表性

② 新的分子时代

A. 除了让真菌-植物共生关系的连续谱更精密解析了，分子证据还揭示了一类新的共生多态性：一个真菌物种能与不同植物类群形成不同类型的菌根：比如EM真菌的物种可以形成草莓树菌根、兰科菌根、菌生植物菌根，甚至杜鹃花科菌根

a. 来自对菌生植物的研究也确立了寄生性植物存在，以及非常专性亲和的共生系统

B. 至此，新分子证据的积累提供了网络形成的不同基础：

a. 植物中心：一个植物形成多个同类或者跨类菌根（比如杨树，可以同时形成外生菌根和丛枝菌根）

b. 真菌中心

 一株真菌同时共生多个同类群的植物，形成一种菌根（类群内网络）

 一株真菌同时共生不同类群的植物，形成多样的菌根（跨类网络）

c. Many ecological and management implications flow from our understanding of CMNs as structured by mycorrhiza specificity processes and phenomena. Molina and Trappe (1982) first used “common mycelial networks” in a discussion of mycorrhiza specificity expressed by the arbutoid mycorrhizal plants Arbutus menziesii and Arctostaphylos uva-ursi; the authors hypothesized that these plants maintain EM fungus diversity in forest ecosystems following disturbance and benefit seedling establishment of later-seral Pinaceae because seedlings can exploit the mycorrhizal networks supported by these arbutoid plants

三、本章结构

1. 主要目的是介绍菌根特异性如何影响网络的建立

2. 介绍有关菌根特异性相关的词库lexicon

3. 以EM为主体介绍特意性的结构

4. 特异性如何影响群落结构的例子

一、菌根相容性compatibility

1. 这里指的是真菌和植物能否形成菌根

2. 判别标准是形态学上的结构

① 丛枝菌根：丛枝arbuscule

② 外生菌根：哈蒂氏网 Hartig net

③ 杜鹃科/草莓树菌根：卷须 coil

④ 兰花菌根：菌丝团peloton

⑤ 菌生植物菌根：菌丝钉hyphal peg

3. 注意这里的形态学标准只能确定真菌和植物可以建立共生关系（symbiosis），但是不能保证是互惠共生（mutualism），因为寄生状态的菌根也需要这些结构。因此这个标准更注重的是生理学上的相容性，而不是“功能相容性（暗指互惠共生的相容性建立，因为植物有能力抵制和惩罚寄生性的菌根）”

二、特异性的程度degree of specificity

1. 真菌的寄主范围，分为三类

① “狭域寄主种”：只能和单一或者单属物种建立关系

② “中域寄主种”：一个科，或者一个分类单元（该分类单元小于种子植物）

③ “广域寄主种”：寄主包括多个科、多个类群

Species in the hypogeous EM genus Rhizopogon are classic examples that express primarily narrow specificity, associating with single genera within Pinaceae (e.g., R. vinicolor and Pseudotsuga); some Rhizopogon species, however, are intermediate and associate with several host genera within Pinaceae (e.g., R. salebrosus) (Molina et al. 1999). Cenococcum geophilum, with its cosmopolitan range and association with most EM hosts, exemplifies a broad host range EM fungus.

2. 物种复合体：一类真菌，其实不是单一物种。这个复合体表现出整体很广的寄主选择，但是每一个遗传单体的选择性很高（什么叫复合物种？）

三、菌根类型的忠诚度fidelity

1. 忠诚度一词在以往的植物生态学研究中指一个植物在不同的群落组成中所表现的“稳定性”。在这里我们借用这个概念来描述植物形成的菌根类型的稳定性，也即植物能形成多少种菌根

2. 这个概念帮助我们预测一个菌丝网络结构。很重要的是，具有低忠诚度的植物（能形成两种以上菌根）具有联系不同菌根网络的枢纽作用（比如把AM网络和EM网络关联）

3. 大部分的植物都只能和真菌形成一种菌根

4. 一些例外：

① 壳斗科Fag-aceae的一些属，比如eucalyptus桉树，populus 杨属，Salix柳属，兼容EM和AM

A. 但是这些树大部分是幼年依赖AM成年后转为EM

② AM也在一些典型的非AM植物（松属）中报道出现。但一些也许只是偶然定植，不过也有实验表示这些菌根也能促进养分的吸收

③ 更常见的例外：参与草莓树菌根、杜鹃菌根、兰科菌根、菌生植物菌根的EM真菌

A. 森林的菌生植物主要依赖的菌都是EM菌——菌生植物通常具有很狭窄的特异性，只能和少数菌共生

B. 杜鹃花科菌根和EM菌根的普遍共存让科学家考虑上林冠层的松树和林下的杜鹃花科植物是不是建立一种群落关系

C. 一些EM真菌或者杜鹃花科菌还能和原始植物比如地钱形成共生

D. 一个特殊的真菌类群Sebeniales能同时形成EM/兰科/杜鹃花。

④ 这种忠诚度的破缺提出了一个有趣的机理研究问题：在共生结构上，植物和真菌哪一方掌控这个过程？是哪些过程指导了的特殊共生结构的形成？

四、生态特异性 ecological specificity

1. 类比病理学上的致病三角形，并不是只要能侵害植物的病原菌在野外就一定能侵害成功。实验室结果和野外结果显示的菌根数量不一致指出，在野外真菌植物之间的选择还有其他因素的影响。这种环境导致的特异性变化称之为生态特异性

2. 很常讨论的影响因素是其他植物的存在使得菌根关系“易主”

五、寄主偏好和选择 host preference and selectivity

1. 在固定的群落中，植物和真菌能稳定住他们的共生模式，无论随机因素如何变化。同时，多植物共存的时候，一些真菌总会更多地和特定植物建立共生。这种现象被叫做“寄主偏好”或“寄主选择”

2. 造成这种选择的原因是多样的。缺乏研究

In field studies with experimental designs that allow researchers to rule out random affects, consistent patterns of associations between plant and fungal species are observed more or less frequently than expected by chance, despite an absence of compatibility limitations between the symbionts

在实验设计的田野研究中，研究人员可以排除随机影响，尽管共生体之间不存在相容性的限制，但植物和真菌物种之间一致的关联模式比预期的偶然性更多或更少被观察到。

六、寄主转移 host shift

1. 寄主转移是说演化历史上一个真菌由于当地原始寄主的消亡，而开始侵染新的植物，或者植物入侵到新环境之后，真菌开始接纳新植物。寄主转移这个概念强调的是时间上的关系演化，而不是空间上的“新能力构建”

① 这里文中描述比较模糊。重点在于，我们假设真菌在和新植物建立关系的过程中“新获得了识别新寄主的能力”，而不是“本来有这个能力，只是因为源生地没有这样的寄主，所以没有表现出来”

2. 但是这样两种细微的时间先后差别非常难以区分。书中给出的寄主转移的例子都是基于入侵植物和入侵地本土菌根开始建立关系为例子来说明菌根的寄主转移能力的（还需重读）

一、混合丛林中不同寄主的存在使得真菌的寄主范围、特异性程度都会改变

1. 典型案例：“共培养”

① 在松树存在的情况下，EM菌根(Rhizopogon species (Pinaceae specialists) 也能和草莓树arbutus形成菌根，但是在草莓树单作田则不会形成菌根

二、生态特异性和寄主偏好的区分

三、广泛存在的寄主偏好

1. 寄主偏好广泛存在

① 常见的偏好范围是科级别的，而属或者物种层面偏好表现不明显

② 似乎热带地区、硬叶林地区偏好性表现更多，而萨瓦纳稀树草原的群落偏好性不明显。但是暂时没有全球性的数据

2. 寄主偏好不只出现于那些本身就比较狭域寄主的物种上，即使是广域寄主种，也表现出偏好性

3. 野外实验上的困难：采样如何保证全面？如何设计更稳健的方式来监测不同环境中（也就是不同环境偏好性体系下）体系表现的偏好性？

It is critically important that future field studies use robust sampling methods that provide strong statistical inferences regarding the interpretation of host preference patterns.

4. 和其他偏好性一样，寄主偏好也是受到环境影响的

① 物种入侵事件中表现出来的寄主偏好

A. Wolfe and Pringle 2011：一个奇怪的案例，介绍一种毒伞菌属的真菌在欧洲源生地主要和栎属以及其他壳斗科共生，但是在新入侵的北美地区东海岸主要和松科共生，而西海岸则和欧洲源生地一样，依然是栎属。相反作者不认为这表现出毒伞菌是广域寄主，而只是认为它们定植栋数的能力是适应东海岸入侵环境的一种“生态特异性”：也许是因为和松属植物共生使得植物有了更好的适合度，于是在群落中传播更广

They conclude by stating: specificity in local habitats can influence the success of introduced mutualist species even when the species otherwise appears a generalist.

5. 寄主偏好中的重要影响因素：寄主的响应

① Tedersoo 提出几个重要的造成寄主偏好的因素：历史成因，特化的生境，部分自养生活史，系统发生差异

② 在不考虑遗传因素的情况下，学者认为偏好性是“实际生态位”的体现，推测偏好性要么形成于真菌之间的相互竞争，或者源于寄主植物对真菌的特殊回馈

A. 来自AM的一些实验更支持后一种观点：寄主植物的特殊关照造成了偏好性

a. Bever的实验表明葱属植物同时接种两种菌根后，植物只会给有益真菌提供光合产物，并且这种合作增加益生菌的孢子产生数量（一种适合度的体现）；而有害真菌啧不能享受C分配

b. Kiers的实验验证了三种菌根参与形成的共侵染中，苜蓿寄主会分配更多的C给提供P很多的菌；并且菌做出同样的事情：提供更多的P给C供应充足的根

B. EM真菌体系中寄主的特殊恩惠研究较少。一些研究主要集中在揭示了广域寄主菌种给寄主的好处比不上那些和寄主狭域共生的菌。这种更强的合作关系解释了狭域关系的演化

a. 实验证据：15N/14N同位素配比差异揭示了更强的N供应；另外一个实验显示狭域种能提供更强的抗旱性

四、总结：生态特异性和寄主偏好的研究意义

1. 寄主选择能预测群落中会形成什么样的菌丝网络，并且能显著影响菌丝网络的结构。CNM的差异对于生态意义影响很大（演替、系统恢复）

2. 寄主特异性也能解释物种共存机制（生态位分化，同域物种形成，多样性促进）

3. 很后，寄主特异性是菌根共生关系演化史的一个重要依据，可以用来研究寄主转移和真菌物种形成

4. 物种名录（均需要斜体）

① 植物

A. Larix 落叶松属

B. Picea 云杉属

C. Abies 冷杉属

D. Betula 桦木属 birch

E. Arctostaphylos 熊果属

F. Vaccinium 越橘属

G. Quercus 栎属

② 菌

A. Thelephora革菌属

B. Rhizopogon 须腹菌属

C. Boletus 牛肝菌属

(formal) to come or result from sth 来自；由…引起

Many ecological and management implications flow from our understanding of CMNs as structured by mycorrhiza specificity processes and phenomena. Molina and Trappe (1982) first used “common mycelial networks” in a discussion of mycorrhiza specificity expressed by the arbutoid mycorrhizal plants Arbutus menziesii and Arctostaphylos uva-ursi ; the authors hypothesized that these plants maintain EM fungus diversity in forest ecosystems following disturbance and benefit seedling establishment of later-seral Pinaceae because seedlings can exploit the mycorrhizal networks supported by these arbutoid plants

N-COUNT A reservoir of something is a large quantity of it that is available for use when needed. 大量储备

有水库，也有大量储备的意思。这个词很常用，比如原文这里用来表示“种质资源库”这样的意思。化学实验里的“母液”也是这个词。

Arbutoid hosts have a broad receptivity towards a diversity of EM fungi (Zak 1976a, b), leading Molina and Trappe (1982) to hypothesize that the plants maintain a reservoir of diverse EM fungi through disturbance events that support the establishment of later successional Pinaceae.

油草克除草剂是什么成份？

我国植物源农药研究现状、应用情况及发展

现阶段，寻找两高农药的替代品已成为我国农业的紧要任务，低毒、不破坏环境、残留少、选择性强，不杀伤天敌．可利用时间长、用量少、使用成本低的植物源农药无疑成了人们的一种选择。

多年来，化学农药因效果好、见效快、价格便宜、使用方便而在全世界范围内被广泛使用。然而，其引起的环境问题也越来越明显。从明年开始．甲胺磷、甲基对硫磷、对硫磷、久效磷、磷胺等5种高毒有机磷农药将被禁止在我国境内销售和使用，因此．寻找两高农药的替代品成为我国农业的紧要任务。

生物农药不污染环境，不产生公害，具有广阔的发展前景，植物源农药是其重要组成部分。植物源农药是利用植物的某些部位或提取其有效成份制成具有杀虫或杀菌作用的农药，大多数低毒，不破坏环境，残留少，选择性强，不杀伤天敌，可利用时间长，用量少，使用成本低。在全世界面临人口迅速增长、环境污染压力日趋严重的今天，更深入、更广泛的研究和开发安全、无毒、来源广、成本低的植物源农药具有重要的经济意义、生态意义和社会意义。

我国植物源农药的研制相当活跃

开发植物源农药．主要是利用植物体内的次生代谢物质．这些物质是植物自身防御体系与有害生物的相互适应演变、协同进化的结果，其中的多种次生代谢物质具有杀虫抑菌或除草活性。按照swaln的研究，植物中的次生代谢物，超过了40万种，主要包拮木脂素类，黄酮、生物碱、萜烯类、特异氨基酸等等。国外研究较多的有印楝、番荔枝、巴婆、万寿菊等植物，其中很成功的当属印楝。我国在具活性成分植物的筛选、活性成分的生物测定及毒理学等理论研究领域均取得了显著的成果，在产品研发和实际应用方面处于领先地位。目前，国外着重于从植物中寻找具有农药活性的物质作为合成高效低毒的化学农药的先导化合物；而我国由于植物资源丰富，主要研究直接应用具有农药活性的植物资源作为植物农药的原料。

近年来在我国植物源农药的研制相当活跃。在一些相关科研单位和农药企业的努力下，取得了显著进步。据2。03年“农药登记公告汇编“(中华人民共和国农业部农药检定所)的资料显示，我国有1 3省2个直辖市的31个厂家生产39种植物源农药产品，其中苦参碱产品有24个(含复配)．另外还有印楝素、楝素，苦皮滕素、除虫菊素、野燕枯、鱼藤酮和苦豆素等产品。“十五“和“十一五”期间*科技攻关重大项目、科技成果转化基金等项目都有植物源农药项目资助或规划。

植物源农药种类及研究与应用

植物源杀虫剂。植物源杀虫剂是植物源农药中研究很多的一类，对其研究一般集中在楝科、卫矛科、柏科、豆科。菊科，唇形科、蓼科等植物上。上世纪90年代以来，我国科研人员在对姜科植物、苦木科植物、天南星科植物、樟科植物进行杀虫作用评价方面做了大量工作，吴文君等(]993)对苦皮藤进行了长期研究，鉴定出三种有效成分的结构，为新型农药的开发奠定了基础；张兴等(1 999)对采自西北地区的475种植物样品在室内测定其丙酮提取物对赤拟谷盗、粘虫、玉米象等为试虫的生物活性，筛选出对试虫有50％以上生物活性的植物样品1 28种，并认为砂地柏、牛心朴等1 0余种植物具有明显的开发研究价值；徐汉虹等(1 994)分别对猪毛蒿、肉桂等近十种植物精油的杀虫作用进行了较为深入的研究。

植物源杀菌剂。植物源杀菌剂利用植物含有的某些抗菌物质或诱导产生的植物防卫素，杀或有效抑制某些病原菌的生长发育。植物体内的抗菌化合物是具有抗菌活性的次生代谢产物，包含了生物碱类、类黄酮类、蛋白质类、有机酸类和酚类化合物等不同类型，如毛蒿素(Capilln)、皂角苷类(saponln)。Wilkins等(1 989)报道有1 389种植物有可能作为杀菌剂，植物中的抗毒素、类黄酮，罹病相关的蛋白质、有机酸和酚类化合物等均有杀菌或抗菌活性(吴轶青译，1 996)。当前国内的研究热点主要集中在大蒜、乌药、甘松、麻黄、细辛、胡敏藤、黄柏、连翘、板蓝根等植物上。

真菌病害防治方面．赵纯森等(1 994)发现厚朴树(Magnolis offcinalis)叶的粗提物对禾谷镰刀菌、棉花炭疽刺盘孢菌等1 0种植物病原真菌具有很强的抑菌活性，后发现其中的抑菌活性物质为厚朴酚及和厚朴酚张国珍等(1 995)从药用植物中筛选出对植物病原真菌有较强抑制作用的挥发油，并以麻黄(Ephedra sInica)油干口细辛(A sarum heterotropoides var，mandshurlcum)油的抑菌活性作了较为细致的研究；辛玉成等(1 995)将8种中草药配制成 NX-08复合剂，经室内和田间测定显示，该复合剂对苹果腐烂病、苹果枝干轮纹病和苹果干腐病的治疗防病效果显著。

细菌病害防治方面，郭权等(1 985)研究发现木麻黄的乙醇抽提物对青枯菌、水稻白叶枯有显著的抑制作用：佘世望等(1 997)对60味食药两用中药进行抗1 9种常见食品腐败菌的快速筛选，发现乌梅对所测普通变形杆菌，荧光假单胞菌属、蜡状芽孢杆菌、枯草芽孢杆菌有强烈抑制作用；郑永权等(1 999)研究发现，苦参提取物对大肠杆菌、金黄色链球菌及表皮葡萄球菌均有明显抑制作用。

植物源抗病毒剂。筛选植物源抗病毒剂的工作主要集中在花叶病毒方面。林存銮等(1 987)发现．小藜和玉簪的抽提液对番茄花叶(TMV-T)病有一定的治疗作用；朱水方等(1 989)报道。连翘、大黄、板蓝根的提取液对TMV具有稳定的疗效；侯玉霞等(2000)采用病毒／细胞高效同步侵染体系对3种植物提取物抗 TMV的活性及对叶绿体的保护作用进行研究，其中射干抽提物对病毒增殖抑制率为76 04％，而吴茱萸抽提物抑制病毒对叶绿体的破坏作用达到8g 58％，筛选出了作用方式不同的抗病毒物质。

尽管对于植物源抗病毒剂的研究比较广泛，但截至目前还没有一种理想的药剂能够有效的防治植物病毒病。因此，要从植物中开发出安全、有效的抗病毒剂，还需对植物提取液中抗病毒活性物质以及其作用机理等方面深入研究。

植物源杀线虫剂。除了在杀虫、抑菌活性方面的研究外，美国、英国等*已开始用植物防治植物寄生线虫。至1 998年已发现臭蒿、孔雀草、向日葵、印楝等41属47种植物可用于防治线虫。

植物源除草剂。对植物源除草剂的开发及农业上杂草的综合治理是基于植物间的异株克生作用。具有异株克生作用的化合物是植物的次生代谢产物，对植物的生长发育及代谢过程均能产生影响。目前世界上已发现30多个科的植物含有近百种具有除草活性的天然化合物。杨善超等(1 992)发现小麦对白茅有异株克生作用．耕翻种麦能够彻底防除白茅，并从麦根、颍壳中分离到杀草活性物质．有望开发出防治白茅等杂草的植物源除草剂。李善林等(1 996)在进行化感效应测定时发现，小麦中还存在显著抑制反枝苋和繁缕两种杂草生长的克生物质．进一步研究发现．小麦颖壳的甲醇洗脱物对白茅有很高的抑制率，有望开发成防除白茅等杂草的植物源除草剂。此外，人们还对水稻、紫泽茎兰、狼毒等植物中的异株克生现象进行了研究。

虽然目前植物源除草剂还停留在实验室阶段，但随着技术的迅猛发展，商品化的植物源除草剂问世指日可待。

我国植物源农药发展缓慢原因及建议

随着我国对生物农药研究应用的逐渐重视，植物源农药的研制也愈发活跃，进步显著，但与发达*相比，发展还很缓慢。究其原因主要有以下几方面：

活性成分的含量和活性强度的不稳定性。植物中的次生物质是植物为抵御有害生物、不利环境而产生的，因此同一种植物中的具有农药活性的物质含量可因植物的生长发育阶段、组织器官．地域分布、生长环境等因素的不同而不同。另外．植物中的活性成分易光解或水解．在环境中不稳定。

建议在开发利用植物源农药时应注意建立严格的化学和生物学相结合的检测技术来保证产品中有效成分的含量和活性强度。

活性成分的复杂性。植物中次生代谢物种类多，含量差异大，这不仅使分离、纯化工作较难，而且难以明确各成分间的关系是协同、增效还是拮抗，给毒理学研究造成困难。

建议在研究中明确植物的次生代谢物中各主要成分问的关系(协同、增效或拮抗)，有利于更好地开发应用植物源农药。

制剂加工的特殊性。植物源农药在作用方式和作用机理上与合成农药有一定差异，因此，在剂型和药剂分散体系的设计上也要有所不同，对这些相关领域进行深入研究将更有效地发挥植物源农药在田间的使用效果，这在印楝的开发中已给予了充分的重视。

建议精油可加工成缓释剂、气雾剂使用l植物材料难以粉碎到一定细度，故应加工为液剂．如水剂、微乳剂、水乳剂等，其他剂型的助剂也应选择无毒的材料。

植物源农药的作用方式特殊．作用速度相对缓慢，其田间使用技术除与常规农药相同(如适时、适量、喷洒均匀周到)外．还应根据其特点灵活运用．以保证防治效果正常发挥。如虫口密度过大时，应先使用速效型药剂压低虫口，然后适当使用植物杀虫剂进行扫残；或以低毒、速效的化学杀虫剂和植物源杀虫剂混用；引诱剂应结合速效性合成农药来应用；拒食剂应考虑和内吸性药剂或持效性触杀剂结合使用。总之，在lPM(英文Integreted Pest Management的缩写，中文意思是“有害生物综合治理”)中应把植物源农药当作一种协调、管理手段，而不应象使用化学农药一样，将其作为一种”应急”措施。

中国农资

追问：

这只是网上的,有没有其它答案啊

「地球生物全系列——从单细胞到人类」真菌界概述（四）

真菌界概述（四）

许多真菌的结构都是微观的，而主要宏观的结构如子实体又非常柔软且容易分解，因此与动植物相比，真菌的化石记录相当稀少，且真菌化石很难与其他微生物的化石分别，除非有现生真菌与化石物种外型相似才较容易分辨。真菌的化石常与动植物的一起出现，通常经过薄切面后，使用光学显微镜或透射电子显微镜检视观察，研究压纹化石（英语：Compression fossil）时则会使用酸性溶液将化石周围的基质溶解，再使用光学显微镜或扫描电子显微镜观察表面的详细构造。

很早具有典型真菌特征的化石可追溯至24亿年前的古元古代，是栖息于海底的生物，具有可能可以互相接合的菌丝状构造。另有研究比较相关生物类群的演化速率，以分子时钟（英语：Molecular clock）推测真菌应该在7-10亿年前出现。古生代时许多真菌都是水生的，且像现生的壶菌一样具有鞭毛，但也有部分真菌在寒武纪时就开始往陆地生长，较陆生植物的出现早上许多。随后真菌演化出许多陆地生活所需的特征，包括寄生、腐生、菌根与地衣等与其他生物的交互作用。2009年的一篇研究显示子囊菌门的共祖便是腐生的，随后多次在不同类群中，独立演化出地衣的生长型态。有奥陶纪的真菌化石出现菌丝、孢子等特征，和现生的球囊菌门真菌相当类似，当时陆生植物仍只有许多类似现生苔藓的种类，尚不具有维管束。原杉藻是一种重要的真菌化石，出现于志留纪晚期，并可能是当时陆地上高度很高的生物。泥盆纪早期真菌化石的种类开始变多，且特征较更早化石典型许多，对其是否属于真菌争议渐渐减少，许多壶菌门与接合菌门的化石在莱尼燧石层（英语：Rhynie chert）中被发现。担子菌门与子囊菌门也差不多在此时出现，到石炭纪的宾夕法尼亚世，多数现生真菌的纲都已经出现了。

形态类似地衣的化石很早在5-6亿年前的陡山沱（英语：Doushantuo Formation）地层中就出现了，地衣是早期陆域生态系的重要成员，很早确定为地衣的化石出现于4亿年前，约与很早的子实体化石同期。具有与现生担子菌扣子体相似结构的化石也出现于石炭纪宾夕法尼亚世的地层，与一株蕨类的化石一起出现。同担子菌亚纲的真菌化石则相对较少，两枚保存于琥珀中的标本显示白垩纪晚期（9000万年前）已有外型类似菇类的真菌出现。

二叠纪－三叠纪灭绝事件之后不久，真菌化石大量出现（P-T fungal spike），孢子也大量出现在岩层中，显示真菌当时是相当占优势的生物，这个时期的化石几乎全部都是真菌化石，但也有研究反对这项理论，认为此一爆发并没有发生在世界所有地区，某些地区发现的真菌化石爆发和灭绝事件时间不完全吻合，且不易区分这些孢子是来自真菌或藻类。

6550万年前，许多动植物在白垩纪－第三纪灭绝事件中灭绝，紧接着真菌再度大量出现，可能是世界各地森林大面积毁灭后，为真菌提供腐生生长的环境造成。而真菌的拓殖甚至可能助长了哺乳类在新生代的繁盛，因为哺乳类相对于其他脊椎动物，对真菌感染的抗性特别大。

真菌学在传统上常被划归在植物学的范畴中，但真菌其实与动物的亲缘更为接近。分类学家根据分子系统发生学的分析，将广义的真菌与动物（菌物总界与动物总界）共同组为称为后鞭毛生物的单系群，而真菌界本身也是一个单系群。真菌的分类经常有所变动，特别是DNA定序技术普及后，越来越多研究比较不同真菌间的DNA序列，不断提出新的分类观点。许多传统上以形态或交配实验所做出的分类系统受到相当大的挑战。

目前真菌较高层级的分类系统仍有很大争议，新理论不断被提出，各个分类阶层的名称均常有变动。且同一种真菌还可能在生活史的不同阶段，例如无性与有性世代拥有数种不同的学名，使真菌分类更加复杂。目前有Index Fungorum与ITIS等数据库记录了所有现生真菌的名称（包含旧分类系统下的同物异名在内），许多分类学家也正努力建立更一致的命名系统。

2007年，在数十位真菌学家与分类学家通力研究之下，诞生了一套新的真菌分类系统，其中子囊菌门与担子菌门共同组成双核亚界，是真菌中多样性很高的类群，包含绝大多数蕈类、植物病原菌以及用于食品工业的真菌，而传统分类系统中的壶菌门与接合菌门都被认为是并系群而有所调整，芽枝霉门与新美鞭菌门从壶菌门中分出，成为两个独立的门，接合菌门则被分拆成球囊菌门与毛霉亚门、虫霉亚门（英语：entomophthoromycotina）、梳霉亚门和捕虫霉亚门（英语：Zoopagomycotina）等四个亚门。2018年，Tedersoo等人又发表了新的真菌分类系统，将真菌细分至十八个门。

随着分子系统发生学的问世，以DNA序列为基础的分类方式渐渐取代传统分类系统，微孢子虫等许多在五界说被归属于原生生物的微生物被发现与真菌的亲缘关系较近，而被归入真菌界中。隐真菌门的物种是土壤与水中的微生物，它们缺乏细胞壁，可以像动物般以吞噬作用取得养分，DNA序列分析显示它们与微孢子虫关系非常密切，后者可能是隐真菌门中一个特别深的演化支，两者共同构成其他真菌的姊妹群，也被划入真菌界中。另外核形虫与泉生虫（英语：Fonticula）也与真菌的亲缘关系接近，两者构成包含隐真菌门在内所有真菌的姊妹群，也有研究者将它们划入真菌界，但因两者缺乏许多真菌共有的特征，生活型态也与真菌差异较大，Terdersoo等人2018年发表的分类系统选择将它们独立成一个界：核形虫界（Nucleariae）。核形虫界虽不属于真菌界，但因与真菌亲缘关系密切，是广义的真菌：真菌总界的成员。

2007年的分类系统将真菌分为微孢子虫门、壶菌门、芽枝霉门、新美鞭菌门、子囊菌门、担子菌门以及原属接合菌门的球囊菌门与毛霉亚门、虫霉亚门（英语：Entomophthorales）、梳霉亚门和捕虫霉亚门（英语：Zoopagomycotina）等四个亚门。2018年Tedersoo等人发表的分类系统则总共将真菌分为九大类群，共计十八个门。包括隐真菌门、Aphelidiomycota（英语：Aphelidiomycota）、芽枝霉门、壶菌门、单毛壶菌门（英语：Monoblepharomycota）、新美鞭菌门、油壶菌门（英语：Olpidiomycota）、蛙粪霉门（英语：Basidiobolomycota）、捕虫霉门（英语：Zoopagomycota）、梳霉门（英语：Kickxellomycota）、虫霉门、Calcarisporiellomycota（英语：Calcarisporiellomycota）、毛霉门、被孢霉门（英语：Mortierellomycota）、球囊菌门、根肿黑粉菌门（英语：Entorrhizomycota）、子囊菌门与担子菌门。此次分类所作出较大的改动包括认定微孢子虫属于隐真菌门、将壶菌门进一步分拆、将蛙粪霉从虫霉菌中独立成一门、将毛霉门进一步分拆等。

微孢子虫是一种单细胞生物，在动物细胞内行绝对寄生，因为基因组与胞器都高度退化，一度被认为是原始的真核生物。不过DNA序列分析显示微孢子虫属于真菌，而且是所有其他真菌的姊妹群，是真菌演化上很早分支的演化支。近期还有研究认为微孢子虫与隐真菌门关系密切。

壶菌与现在已独立出去的新美鞭菌门、单毛壶菌门（英语：Monoblepharomycota）、芽枝霉门，以及新加入真菌界的隐真菌门与Aphelidiomycota等类群具有动孢子（英语：zoospore），动孢子具有鞭毛而可以在水中移动，因此壶菌早期曾被归为原生动物，后来rDNA序列分析显示壶菌属于真菌，而且也是真菌演化上较早分支的类群。

芽枝霉门以前认为是壶菌的一支，不过新研究显示芽枝霉门不属于壶菌，且可能是双核亚界与原属接合菌门的所有真菌的姊妹群，在演化上比壶菌晚分支出去。芽枝霉门多为腐生，以分解有机质为生，其成员可寄生于许多真核生物。与壶菌不同的是芽枝霉门的生活史存在世代交替。

新美鞭菌门也曾被认为是壶菌的一支，其成员是厌氧生物，栖息于大型草食动物的消化系统中，它们缺乏线粒体，但有线粒体衍生而成的氢酶体（英语：hydrogenosome）。新美鞭菌门的动孢子也具有鞭毛，还有些种类具有多根鞭毛。

过去属于接合菌门的生物现在被分拆成数个不同的门，这些真菌包括会造成面包发霉的黑根霉、可用来制作豆腐乳的毛霉与根毛霉（英语：Rhizomucor）。球囊菌门的真菌会侵入植物的根部，与植物形成丛枝菌根（英语：arbuscular mycorrhizae），可帮助植物吸收土壤中的水分与无机盐，丛枝菌根在演化上出现的时间相当早，很早可追溯至四亿年前，这种互利共生可能对陆生植物早期在陆地的适应非常重要。球囊菌门过去属于接合菌门，2001年首次被提升到门的地位。

子囊菌门是真菌中种类很多的类群，它们可经由减数分裂，在子囊中产生子囊孢子。子囊菌门的真菌包含羊肚菌、松露、多数酵母菌（念珠菌、酿酒酵母、克鲁维酵母（英语：Kluyveromyces）与毕赤酵母（英语：毕赤酵母））以及某些蕈类，生活型态包括腐生、寄生或与藻类或蓝绿菌形成互利共生的地衣。子囊菌门的重要成员还有曲霉属、青霉菌、麦角菌与镰孢菌属等。有一些子囊菌只有观察到无性生殖，没有观察到有性世代的纪录，但分子序列分析足以显示其分类属于子囊菌门。也因为其减数分裂的产物子囊孢子会留在子囊中，而不会马上散播出去，子囊菌门的真菌（粉色面包霉菌）曾是遗传学研究的重要工具。

担子菌门真菌的菌丝特化出称为担子的杆状构造，以进行减数分裂产生担孢子。多数蕈类都属于担子菌门，另外担子菌门还包括锈菌与黑粉菌等重要的植物病原菌、存在于人类皮肤上的马拉色菌属以及可造成机会性感染的新型隐球菌。

因为形态与生活史的相似，黏菌、卵菌与丝壶菌（英语：Hyphochytriomycetes）都曾被认为是真菌界的生物，卵菌、丝壶菌与部分属于“Phytomyxea”的黏菌，曾与壶菌共同组成真菌界下的鞭毛菌亚门（英语：Mastigomycotina），更早以前还有藻菌（英语：Phycomycetes）、裸菌（英语：Gymnomycota）等分类单元。这些生物现在都已经证实不属于真菌，真菌的细胞壁是由几丁质组成，不含有纤维素，卵菌的细胞壁则是纤维素组成的，丝壶菌的细胞壁兼有几丁质与细胞壁，多数黏菌生活史中的多数阶段则是没有细胞壁的，而是以吞噬作用取得养分，不像真菌、卵菌与丝壶菌是以渗透营养（英语：osmotrophy）的方式，以扩散作用从胞外吸收养分，很好的例外是网状黏菌（英语：Labyrinthulomycetes），这种黏菌具有细胞壁，且也是使用渗透营养的方式获得养份。现在的分类系统中，卵菌、丝壶菌与网状黏菌同属SAR超类群，黏菌则包含属于变形虫界、有孔虫界、古虫界的物种，与真菌的亲缘关系都相当远，它们相似的外型与生活史只是趋同演化的结果。另外有一种黏菌称为泉生虫（英语：Fonticula），与真菌、动物同属后鞭毛生物，且与核形虫共同组成现生真菌的姊妹群，与现生真菌关系非常密切。不过关于这些生物的研究有时仍被视为真菌学的范畴，出现在真菌学的课本与论文中。

外毛菌目（英语：Eccrinales）、变形毛菌目（英语：Amoebidiales）、鱼孢菌（英语：Ichthyophonus）与珊瑚壶菌（英语：Corallochytrium）原本归属接合菌门，后来发现它们属于动物总界，与现生动物的关系更为密切，与真菌相似的外型也是趋同演化的结果。芽囊原虫（英语：Blastocystis）与曾被认为是一种酵母菌，Ellobiopsis曾被认为是一种壶菌，两者现在都归属于SAR超类群。

历史上放线菌也曾因可以形成菌丝状的构造而被归为真菌，但很早就被发现属于细菌，不是真核生物。

子囊菌门（Ascomycota）

担子菌门 (Basidiomycota)

芽枝霉门(Blastocladiomycota)

壶菌门(Chytridiomycota)

球囊菌门 (Glomeromycota)

微孢子虫门（Microsporidia）

新丽鞭毛菌门（Neocallimastigomycota）

接合菌门 (Zygomycota)

虫霉门（Entomophthoromycota）

毛霉门（Mucoromycota）

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